Het Universiteitsmuseum toont de verzamelingen die de universiteit sinds de oprichting in 1636 heeft opgebouwd: anatomische preparaten en wassen modellen, medische instrumenten voor tandheelkunde en oogheelkunde, opgezette dieren, skeletten en fossielen (rariteitenkabinet), en de standaard voor een meter en een kilogram. Het Jeugdlab is speciaal voor jongere bezoekers ingericht. Achter het museum ligt een botanische tuin, de Oude Hortus, uit 1724, met kassen.